海洋生物生化与分子生物学：主要研究海洋动物、植物和微生物的生物化学和分子生物学，重点研究海洋生物的功能基因、蛋白质组学、病毒学、基因工程、生物能源开发和微生物生物技术等。

海洋生物遗传育种学：主要研究海洋生物的遗传多样性与分子系统学，海洋经济生物重要经济性状的功能基因组学，生物信息学，海洋生物数量遗传学，分子育种学方法，海洋生物育种技术等。

海洋生物活性物质及其功能特性：运用化学和生物学相结合的方法，研究各种海洋生物活性物质的分离提取、鉴定及其利用，主要研究海洋药物、海洋生物毒素、海洋防污活性物质、海洋植物生物活性物质等。